La ligne ferroviaire des horlogers fait l’objet d’un programme de travaux de modernisation des voies. Une première phase a été réalisée en 2021 permettant de régénérer la ligne à 50%. Trois ans après, les travaux entreront dans la deuxième phase du 4 mars au 31 octobre 2024 avec une interruption totale des circulations ferroviaires entre Besançon-Viotte et Le Locle.
La modernisation de cette ligne permettra d’améliorer sa performance, son attractivité en permettant un retour à la vitesse d’origine, une amélioration du confort ou une accessibilité aux personnes à mobilité réduite à Besançon-Mouillère.